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样本裂解: 如何选择适当的裂解介质

我们的裂解方案基于以研磨珠为介质的机械破碎均质技术。以MP Bio裂解介质系列产品为例,行之有效的裂解方案设计需要依据裂解介质的大小、形状、材质与组成部分,区分其作用效果并针对各种样本性状恰当予以选择。

您在为样品制备挑选最佳的裂解介质种类时,建议您综合考虑样本的刚度与韧性,希望取得的研磨粒径以及目标产物的分子稳定性。 MP Bio可为农业领域相关实验室提供全套完整裂解解决方案,提供多种类型的裂解介质选项,普适于植物组织与环境样本。

有效破碎植物细胞壁,轻松均质化环境样本

下面我们来列举一些常用的植物细胞破碎领域的适用裂解介质。

  • 石榴石基质 (裂解介质 A) 可以被用来裂解几乎任何植物样品类型以及微生物和动物组织和细胞。裂解介质 A可同时提供极高的剪切力与冲击力,使得其尤其适用于致密与富有弹性的细胞壁;但力度太强使得其不适用于环境样本,以及提取RNA的样本前处理工作。
  • 陶瓷珠基质 (裂解介质 D裂解介质 M) 具有多种尺寸规格,适用于提取植物样本中DNA、RNA和蛋白质的试验设计.其中,尺寸较小的陶瓷珠更适用于较为柔软的植物组织(叶、茎、花),而某些植物种子和针叶可能需要尺寸较大的陶瓷珠。
  • 不锈钢珠基质 (裂解介质 SS) 可提供较高的冲击力以及较低的剪切力,适用于从细菌、真菌孢子、种子、根和针叶中提取DNA、RNA和蛋白质。

对于土壤、粪便和堆肥等环境样品,由于其组成成分复杂,通常需要先对其微生物多样性进行评估。我们建议您使用多种材质的裂解基质组合来裂解环境样本,以达到理想效果。裂解介质 E 内含有(陶瓷、二氧化硅与玻璃珠)组合基质,对于裂解环境样本中的多种微生物都有普适性,可取得良好裂解效果。

常见问题解决办法速览

硬度超高,难以处理的样本: 必要时可使用干磨或低温干磨, 但请注意,干磨时会在工作区域局部堆积大量热量,而低温方法涉及要在极低温度条件下操作 — 这两种场景都有一定概率损坏裂解介质容器管壁。我们建议您采取以下措施来应对:

由于环境样品中微生物数量少,蛋白酶或样品污染物降解,或由于研磨过程中产生的热量富集,有可能导致植物与环境样本中核酸提取产量偏低。我们建议您采取以下措施予以应对:

  • 尽可能使用新鲜的土壤样本,以避免微生物损失。
  • 检查裂解方案所产生的研磨强度。
  • 使用金属材质的裂解介质管,以避免塑料可能成为潜在污染源。
  • 在样品制备过程之前和全过程中冷却样品,以避免过热。

当裂解方案设计过于激进时,裂解珠的物理冲击可能导致分子剪切力度过大,进而导致目标分子的分子量过低。我们建议您采取以下措施予以应对:

  • 考虑使用低剪切力、中等冲击力的裂解介质珠,例如裂解介质 E